生信分析、meta分析、数据挖掘
TCGA、GEO、SEER、Oncomine

小张聊科研

聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。

技术新进展:单细胞测序解析人睾丸中生殖细胞发育

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关于单细胞测序技术,公众号已经发过很多介绍了(见文末相关阅读),今天介绍一篇单细胞测序在干细胞研究中的文章: 干细胞是一种可以自我更新和分化的多潜能细胞,在哺乳动物中,已经发现存在干细胞的组织有皮肤,小肠,肺,骨髓等。不同于雌性的是,雄性生...

了解点冷知识,蛋白质二级结构预测

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上一次小师弟给大家介绍了从蛋白质一级结构预测相关信息的网站——也即ExPASy ProParam的使用,今天我再给大家介绍一下蛋白质二级结构的预测。 在介绍具体的网站和软件使用之前,我想先介绍一下蛋白质二级结构预测的基础知识。 蛋白质二级结...

(文章篇)S5E48:一篇lncRNA课题设计的范本

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最近一直后台有留言,询问一些lncRNA、circRNA等研究策略,以及如何能够看懂别人的工作,了解别人的思路。那么我推荐,看一下小张聊科研七月份公布的《科研修炼手册》,里面整理了很详细,专门有一大章节主讲lncRNA研究思路、方法。这些套...

2斤的生信基金知识,顺丰已发(9月15日)!

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今天发出的手册,我们会单独邮件通知大家,请关注邮箱! 废话不多说,先上图! 部分买书的小伙伴又再次给朋友采购,这是要火的节奏 (部分目录) 偏远地区,周末还没有收到手册的部分小伙伴不要着急,下周周二会全部发货! 提醒:快件从上海发出的,顺丰...

如何入门meta分析并发表第一篇SCI文章?

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对大家来说,发表SCI文章是科研积累的重要产出之一,而系统评价和meta分析不仅能让大家锻炼循证医学的思维方式,更能直接的帮你发表SCI文章。如果你还没有发表过SCI文章,又对各种纷繁复杂的基础实验望而却步,那么你可以考虑发一篇“meta分...

入门必看:miRNA的产生及特征与功能概要

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microRNAs是一类由内源基因编码的非编码单链RNA分子,其长度约为19-25nt,在生物发展进程中具有重要的调节作用。miRNAs主要通过参与基因的转录后调控实现对靶基因的表达调节,其在肿瘤发生发展、生物发育、器官形成、病毒防御、表观...

懒人怎么做肿瘤病人的生存分析?

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大家一直让介绍怎么用TCGA的数据来做预后分析,作为一个懒到不想学R语言的人,小张总想找一些简单的网站用。上次我们以前介绍过一个网站CRN来查各种数据库(GEO、TCGA)等中的lncRNA和mRNA表达结果((工具篇)S5E35:如何在不...

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