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生信私房菜

最有味道的生物信息学与互联网技术分享!

非 root 用户手动编译安装 GCC

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我们知道,关于 GCC 在 CentOS 下通过 yum 安装默认版本号,CentOS 5 是 4.1.2;CentOS 6 是 4.4.7;CentOS 7 是 4.8.3。很多时候在编译安装软件都需要高版本的 GCC,否则就会报错。那么...

“那些你曾羡慕的人啊!”

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我的嫉妒心似乎天生就要比别人强。 我嫉妒那些家境比我好的,挣得比我多的,比我年轻还有才华的,比我长得好看又有趣的。我甚至每天都在想:我要是他们就好了…… 很长一段时间,我想成为任何人,除了我自己。 究其原因,不过是因为对自己的期望值太高。 ...

基于ggplot2的解剖图和组织模块可视化

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摘要 将数据显示到解剖结构上,是一种可以快速观察组织相关信息的便捷技术。然而,绘制组织是一项复杂的任务(a complex task),需要解剖学和艺术方面的专业知识。虽然已经存在可用于在解剖图上显示基因表达的基于网络的应用技术,但是其他非...

CentOS Linux 7 安全基线设置

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作为一个生信人,不管是日常的数据分析还是其他工具应用的开发,服务器的安全始终是一个无法避免的话题。尤其是当我们拿到一台新的服务器,我们需要怎样才能确保它是安全可靠,并最小限度降低它被攻击的可能性? 下面我们就来分享一份关于 CentOS L...

一次 SSH 攻击与处理小记

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这是我在简书看到的一个作者经历,结合小编自己的一些实践,抛砖引玉,给大家分享一下。 有段时间发现集群异常卡顿。担心的事情终于发生了,使用命令 lastb 查看了一下,我的天呢,好多未知的 IP,我随便复制粘贴了一个到百度查询了一下,我日,美...

CentOS Linux 7 配置 nginx 支持 CGI

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Nginx 本身不能执行外部程序,Nginx 处理 PHP 是通过 PHP 的 fastcgi 管理器(php-fpm)进行处理,然后 nginx 再将结果返回给用户;所以如果我们需要通过 cgi 程序(shell、perl、c/c++ 等...

Perl 模块安装总结

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从 1994 年 10 月 17 日发布的 Perl 5.000 起,Perl 增加了模块的概念,用来提供面向对象编程的能力。这是 Perl 语言发展史上的一个里程碑。此后,广大自由软件爱好者开发了大量功能强大、构思精巧的 Perl 模块,...

基因 ID 匹配利器

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一、背景 对于每个生物信息分析的人来说,ID 匹配(映射)是一项非常常见,但又很繁琐的任务。假设,我们有一个来自上游分析的 gene symbol 或报告的 ID 列表,然后我们的下一个分析却需要使用基因 ID(例如 Entrez gene...

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