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生信圈

关注生物医学大数据、以及数据分析方法在转化医学研究中的应用进展,讨论与生物信息相关的一切话题。

活动丨“一战到底”赛况激烈,谁能赢到最后?

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↑ 点击上方“生信圈”关注我们 一战到底之生信知识竞赛 赛程已经过半 吃瓜群众表示 竞争很激烈今天小编放出排名前十的种子选手名单 大家快来看看有木有自己 现在想参加??? 没问题 关注“生信圈”公众号 在对话框内回复“答题”即可参与 中途参...

机器学习|自然语言理解-从规则到深度学习

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本文转载自 云栖社区 ,如有侵权请联系删除。 摘要:自然语言理解是人工智能的核心难题之一,也是目前智能语音交互和人机对话的核心难题。之前写过一篇文章自然语言理解,介绍了当时NLU的系统方案,感兴趣的可以再翻一番,里面介绍过的一些内容不再赘述...

原创干货丨解析孟德尔遗传病研究

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↑ 点击上方“生信圈”关注我们 孟德尔遗传病又称单基因病,是由一个或一对等位基因突变导致的疾病,目前已知有约7000多种。根据遗传模式不同,孟德尔遗传病可分为常染色体显性、常染色体隐性、X伴性显性、X伴性隐性、Y伴性遗传病5种。 01 &n...

原创干货丨外显子组测序知多少

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↑ 点击上方“生信圈”关注我们 外显子组测序概述 1 外显子组定义 外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在...

原创干货丨采用LefSe解析组间微生物构成差异

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↑ 点击上方“生信圈”关注我们 1 简介 LefSe(LDA EffectSize)是一种用于发现高维生物标识和揭示基因组特征的软件。包括基因,代谢和分类,用于区别两个或两个以上的生物条件(或者是类群)。该算法强调的是统计意义和生物相关性。...

PhyD3快速入门

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一. 什么是PhyD3 PhyD3是在d3.js基础上构建的一个系统进化树查看器。开源,可嵌入,可扩展。phyD3支持Newick 和 phyloXML及扩展的phyloXML 。扩展的phyloXML 可以更加便捷的实现我们想要的功能。可...

从GEO数据下载到差异基因表达,看这里!

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1 了解GEO数据库 GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是美国国立生物信息中心NCBI旗下的基因表达谱数据库。创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,换句话说就是,只要是当前已经发表的...

好久不见,生信圈

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“不再去说从前 只是寒暄 对你说一句 只是说一句 好久不见” 已经1年没有登录生信圈了,再一次进入有些近乡情怯,左思右想,只有一句“好久不见”。 微信公众号经历了用户盲目关注的时间,又过了用户疯狂取关的时间,现在的用户会重新关注那些有价值的...

Ingenuity® Variant Analysis TM

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产品介绍 从重测序数据中鉴定因果突变 Ingenuity® Variant AnalysisTM(IVA)结合强大的分析工具和Ingenuity Knowledge Base中精准、精选的生物内容,从人类测序数据中,快速鉴定最引人注目的疾病...

从零开始入门R语言编程

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R语言编程入门 写在前面的 上期推文介绍了如何使用R语言编程进行样本间相关性分析,主要涉及了R语言矩阵、循环、统计分析函数、ggplot2、corrplot等函数包的使用,涉及的知识面较多,如果不是经常做生物信息或者是编程出家,很难在短时间...

meta分析、生信分析

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