生信分析、meta分析、数据挖掘
TCGA、GEO、SEER、Oncomine

生信摆渡人

渡人,亦是渡己。

基因组Survey

admin阅读(41)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词:基因组、survey、调研图 基因组Survey,称之为基因组调研图,顾名思义就是调查物种的基因组特征,主要包括以下几个方面:基因组大小,GC含量、杂合度、重复序列,有无外源污染等。通过调研图可以...

【生信软件篇|遗传图谱】Lep-MAP3

admin阅读(51)评论(0)赞(0)

遗传连锁图谱、F1、CP群体、作图软件、高通量测序 之前介绍了一个近交群体作图软件——MSTmap,本篇介绍一个可以做F1全同胞家系群体的遗传图谱作图软件——Lep-MAP3。该软件2017年发表在Bioinformatics上。 1软件介...

支持向量机(Support Vector Machine)

admin阅读(37)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词:SVM、支持向量机、核函数、分类 支持向量机(Support Vector Machine,简称SVM),是一种机械学习(machine learning)中监督式学习(Supervised le...

【生信软件篇|遗传图谱】MSTmap

admin阅读(59)评论(0)赞(0)

遗传连锁图谱、近交群体、作图软件、F2、DH、RIL 本篇介绍一个针对近交群体构建遗传连锁图谱的软件——MSTmap。2008年发表Plos Genetics上,迄今为止引用将近300次,目前依然是比较流行的作图软件。 1软件介绍 软件为C...

叶绿体基因组(3)

admin阅读(29)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词: 叶绿体、质体、共线性、进化树、单体型网络、祖先性状重构、分歧时间估计、比较基因组学、群体基因组学 作为超级条形码的叶绿体基因组序列最大的作用就是用来做物种间的比较基因组学和群体基因组学分析,这也...

叶绿体基因组(2)

admin阅读(33)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词: 叶绿体、基因组、细胞器、生物信息学 叶绿体基因组的生物信息分析内容还是比较多的,包括基于结构和功能的基础分析,还包含了比较基因组和群体基因组的高级分析。 相对于植物核基因组来讲,叶绿体...

叶绿体基因组(1)

admin阅读(30)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词: 叶绿体、基因组、细胞器 叶绿体基因组作为独立的遗传单位, 多为单性遗传, 进化过程中不经历重组, 受到的选择压力小, 能直接反映植物在长期的进化过程中积累...

遗传连锁图谱(2)

admin阅读(40)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词:遗传连锁图谱、群体构建、分子标记、基因分型、连锁分析、图谱绘制 回顾上一节的内容我们知道绘制遗传连锁图谱的核心是检测基因重组事件发生的频率,为了检测重组频率首先需要构建作图群体,之后在作图群体中检...

遗传连锁图谱(1)

admin阅读(27)评论(0)赞(0)

点击标题下「蓝色微信名」可快速关注 关键词:孟德尔、摩尔根、基因分离、自由组合、连锁互换 还是接着基因定位讲,本系列内容开始对遗传图谱知识的梳理,这一节主要是对遗传学定律的回顾。遗传学的三大定律对于学生物类专业的人来说耳熟能详,但是对于像我...

meta分析、生信分析

meta、生信交流群综合科研交流群