生信分析、meta分析、数据挖掘
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生信媛

生信媛,从1人分享,到多人同行。坚持分享生信入门方法与课程,持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的应用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。

基因组分析:Circos作图基础(三)

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大家好,很高兴又跟大家见面了,上一周我们画出了一个看起来还不错的基因组圈图,但是跟我们的目标还是有一些差距,所以今天我将把该图的终极画法写出来,供大家参考。 紧接着上一周的图形,我们缺少两个信息,一个是GC含量的图示,还有一个是GC偏移的信...

biostar handbook: 第一周笔记汇总+第二周任务布置

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第一周笔记汇总 昨天和一位也在自学生信的同学交流自学的心境,他在我的唆使之下也在简书更新自己的笔记(可以搜索小郑的学习笔记)。期间,他说道 非常庆幸自己能够坚持把自己学到的知识和困惑以文字的形式记录下来。以前导师让我搞网页的时候折腾过Apa...

友军生信技能树居然要进军婚恋市场

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七夕前一周,生信技能树公众号小编讨论群的绝密档案 时间:一周前 Jimmy: 有一个小伙伴问我们生信技能树有没有七夕节活动,就是那种让单身汪摆脱单身的那种众人: …..Jimmy: 大家开动自己小脑袋,帮助广大粉丝脱离单身呀众人: ….. ...

不要轻易相信AnnotationHub的物种注释包

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Bioconductor开发的物种注释包系列集合了一个物种不同来源的注释信息,能够根据基因ID对其进行多种来源的注释,比如说基因的别名,基因的功能等。 我之前也写过一篇文章用Bioconductor对基因组注释介绍如何使用Annotatio...

基因组注释之同源注释

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03-同源预测基因结构 同源预测(homology prediction)利用近缘物种已知基因进行序列比对,找到同源序列。然后在同源序列的基础上,根据基因信号如剪切信号、基因起始和终止密码子对基因结构进行预测,如下示意图: 相对于从头预测的...

Biostar课程:5、6

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#为作者的注释 #*为译者的注释 Lecture 5 – 编写可重复使用的脚本。获取子序列。 # 通过locus号来获取一条序列。 efetch -db nucleotide -id KM233090 -format fasta...

Biostar(大结局):课程29、30

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翻译:生物女博士 注:本系列课程翻译已获得原作者授权。 # 为作者的注释 #* 为译者的注释 Lecture 29 – 比较特征计数软件 # 下载和安装 eXpress cd ~/src #* Mac curl -OL http...

meta分析、生信分析

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