生信分析、meta分析、数据挖掘
TCGA、GEO、SEER、Oncomine

生信媛

生信媛,从1人分享,到多人同行。坚持分享生信入门方法与课程,持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的应用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。

荐货 (1)

admin阅读(66)评论(0)赞(0)

Kim 读完需要 20 分钟 速读仅6分钟 很多小伙伴暂时还没有一台属于自己心心念的 MacBook Pro,没有关系,下面的内容可能对你打造Windwos 10 Pro平台下舒适的生信全栈工作引起严重舒适,建议收藏并实践。(多图预警!!!...

上海生化细胞所曾安课题组招聘博后

admin阅读(94)评论(0)赞(0)

Kim 读完需要 8 分钟 速读仅需3分钟 中科院上海生化细胞研究所曾安课题组开展干细胞调控与组织器官再生相关课题研究。实验室将开发及应用新的单细胞技术和生物信息学工具,结合若干成体干细胞及再生模型,以期望在单细胞水平上解析组织器官再生的保...

儿童节福利,R数据分析大杀器

admin阅读(42)评论(0)赞(0)

作为一个不搞培训,也经常性接不到恰饭推广的公众号,在积累了许久文末微薄广告费后,终于能给粉丝们送点福利了,那么福利内容是啥呢? 就是10个免费的Rsutdio网页版使用账户,它有什么用?以及怎么参加呢? 作为生信、地信、大数据、人工智能领域...

Nanopore测序的基因组组装策略

admin阅读(71)评论(0)赞(0)

目前Nanopore卖点主要是两个角度:第一是Nanopore的读长长,某些情况下能够达到单条上M,但是这种情况可遇而不可求,很多时候只存在于宣传册上。另一个则是Nanpore便宜,这样就能够保证测序深度,从而提高组装质量。 但是Nanop...

ChIPseeker的upsetplot是怎么写的

admin阅读(66)评论(0)赞(0)

在距今2年前的一个日子里,我写了一篇关于upsetR的简单教程。两年过去了,我直接搜upsetR找到的就是我自己的教程。 在这篇教程中,我定了一个计划 下一期写一篇Y叔的 upsetplot是如何写的。 然而两年过去了,我说的那个教程都没有...

什么,居然还有不做实验就能发文章的好事?

admin阅读(39)评论(0)赞(0)

可点击右上角“…”收藏此页面以免下次无法找到 还在认为没有实验就不能发表论文?还在为不精通挖掘GEO,TCGA,等数据库而痛苦不堪?还在为不知道如何找课题找靶点而苦恼?还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神?快来参加莫速乎的用R语言进行科研数...

使用GenomeScope进行基因组分析

admin阅读(51)评论(0)赞(0)

在我写的基因组survey介绍了如何通过jellyfish统计k-mer然后绘制k-mer分布图研究基因组的方法。由于最近又在搞基因组survey,又检索了一波资源,发现了一个分析工具,所以有了这篇教程。 GenomeScope 是2017...

「博客翻译」SNP过滤教程(二)

admin阅读(27)评论(0)赞(0)

原文地址: SNP Filtering Tutorial 接「博客翻译」SNP过滤教程(一) FreeBayes输出结果过滤 下面的教程假设你的结果文件来自于FreeBayes的输出。 FreeBayes的输出信息非常丰富,我们可以根据RA...

meta分析、生信分析

meta、生信交流群综合科研交流群