生信分析、meta分析、数据挖掘
TCGA、GEO、SEER、Oncomine

从PATH说起的shell命令行替换

许久之前,师弟问了我一个问题,为什么shell中添加环境变量的写法是下面这种方式

  1. PATH=~/.lib:$PATH; export PATH

而下面这种会报错呢?

  1. $PATH=~/.lib:$PATH; export PATH

当时我的回答是,”shell就是这样子规定的呀”。 回答的同时,也突然间发现有些自己感觉很熟悉的概念,原来自己并没有那么清楚,因此这一篇讲讲shell的命令行替换。先说结论

shell会在命令执行前对命令行进行一些替换

shell替换有如下几种:

替换 语法 含义
历史 ! 之前使用命令
大括号 {} 制定的文本
代字号 ~username 用户的主目录
变量 $, ${…} shell和环境变量
算术 $((..)) 整数运算
命令替换 `…`, $(…) 运行在子shell里命令的输出
路径名 *,?,[…],[^…] 文件系统中匹配的文件名

历史替换是以 !开头的替换方式,以下面历史记录为例

  1. $ !! # 执行上一个命令,即history

  2. $ !1021 # 支持第1021个命令 即ls

  3. $ !-2 # 执行倒数第二个命令,即ls

大括号替换: 它会一个单词展开为单个单词,可以快速创建有一定规律的文件. 下面这个命令就把”chap0{1..3}”替换成了chap01, chap02, chap03, 以及每个都还有一个html和text对应。

  1. $ mkdir -p chap0{1..3}/{html,text}

  2. $ tree chap0*

  3. chap01

  4. ├── html

  5. └── text

  6. chap02

  7. ├── html

  8. └── text

  9. chap03

  10. ├── html

  11. └── text

代字号代替: 我们经常会看到别人文章会写用 vim~/.bashrc修改家目录下的配置文件,其中 ~默认就会替代成自己家目录路径,可以用 echo~确认。

那么问题来了,如何我想快速到别人的家目录下,应该怎么操作。只要在 ~加上别人的用户名就行了。比如说我/home 下还有一个用户叫做abc, 那么查看它家目录下的内容就是

  1. ls ~abc

注: ~a可以用tab补全成 ~abc

变量替换: shell会把 ${变量名}或者 $变量名替换成变量所指代的具体字符,比如说我将abc指代为 ls,那么shell就会将 $abc解释成 ls,然后执行 ls

  1. abc=ls

  2. $abs

  3. # Desktop  bin    biosoft  blastdb  miniconda3  ncbi

也就是 $PATH=~/.lib:$PATH;exportPATH报错的原因是,shell在执行命令前会把 $PATH成原来PATH里的字符串,显然无法达到修改 PATH的目的

算术替换: shell命令行支持整数型的数学运算,下面的运算都是可以的,但是就别拿100/2.5这种浮点运算为难shell了。

  1. echo $((1+2))

  2. echo $((1-2))

  3. echo $((100*101))

  4. echo $((100/50))

命令替换:这个替换非常的实用,可以将shell命令的输入结果立刻作为输入,而不是额外创建一个变量命。有一个应用场景就是在的分析报告里加上完成时间点

  1. touch reports.$(date +%d%b%Y).log

路径名替换:路径替换的语法就4种, *表示0或更多的任意字符, ?表示一个任意字符, [...]表示括号内的字符之一, [^...]不包括括号内的字符

以上就是shell命令行替换的几种形式。当然为了再一次强调”shell会在命令执行前对命令行进行一些替换“,下面举一个反面例子来说明下。

Linux的 /etc目录下有很多以 conf结尾的配置文件,我们可以用find命令快速的定位到它们。

  1. find /etc -name *.conf

上面的命令看起来没啥毛病,但是只要多做一件事情,就会有报错哦

  1. touch a.conf b.conf

  2. find /etc -name *.conf

  3. # 如下是报错

  4. find: paths must precede expression: b.conf

  5. Usage: find [-H] [-L] [-P] [-Olevel] [-D help|tree|search|stat|rates|opt|exec|time] [path...] [expression]

你会不会好奇,明明是相同的命令,却又不同的境遇呢?让我解释下,在刚开始的时候,文件下面没有”a.conf”,”b.conf”,尽管shell看到”*”会有一种进行通配的冲动,但是很可惜没有对象让它通配。后来我们创建了这两个文件,给shell找到通配的机会,于是实际执行的命令就成了 “find /etc -name a.conf b.conf”。 由于后面这两个是文件路径,不符合find的命令要求,就导致了报错。

其实报错还好,有些时候没有报错,程序运行得到错误的结果反而更惨

如何避免这种错误呢?我们就需要用到 "避免 *这个元字符被shell解释。

除了双引号,避免shell进行替换的符号还有 反斜杠 , 和单引号 ‘. 单引号和双引号的区别在于,单引号内部所有字符都是普通字符而已,而双引号里的美元符号$, 感叹号! 和反引号 ` 还能被shell解释

推荐阅读: Red Hat Linux用户基础

赞(0) 打赏
未经允许不得转载:医学SCI科研之家 » 从PATH说起的shell命令行替换
分享到: 更多 (0)

评论 抢沙发

评论审核已启用。您的评论可能需要一段时间后才能被显示。

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址

meta分析、生信分析

meta、生信交流群综合科研交流群